生物試劑研究人胚胎早期器官形成過程的轉(zhuǎn)錄組研究新進(jìn)展
著床后人胚胎發(fā)育涵蓋了胚胎早期器官形成zui關(guān)鍵時(shí)期,即從Carnegie Stage 9(胚胎發(fā)育第20天,E20)到Carnegie Stage 14(胚胎發(fā)育第32天,E32)。從發(fā)育形態(tài)變化角度,各個(gè)器官經(jīng)歷了從無到有的奇妙過程;從發(fā)育進(jìn)化角度,這個(gè)奇妙過程高度保守;從發(fā)育潛能角度,干性潛能與分化潛能既定時(shí)空程序協(xié)調(diào)性變化。這些背后的分子基礎(chǔ)是遺傳信息表達(dá)精密調(diào)控的基因相互作用網(wǎng)絡(luò)。然而,相比模式生物與體外細(xì)胞模型研究,由于受限于人胚胎研究標(biāo)本以及倫理上的限制,關(guān)于人胚胎發(fā)育的分子機(jī)制知之甚少。
楊穎博士和方海博士等在金穎和張濟(jì)導(dǎo)師的指導(dǎo)下,與新華醫(yī)院婦產(chǎn)科合作,利用臨床藥物流產(chǎn)胚胎,應(yīng)用基因芯片對(duì)該早期器官胚胎發(fā)育6個(gè)連續(xù)階段進(jìn)行基因表達(dá)變化譜刻畫。通過數(shù)據(jù)深層次挖掘并整合功能、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、表型及疾病相關(guān)的數(shù)據(jù)庫,他們發(fā)現(xiàn)整個(gè)胚胎形態(tài)變化受基因表達(dá)譜變化所驅(qū)使,主要包括兩組基因:呈現(xiàn)逐漸下調(diào)變化趨勢(shì)的基因負(fù)責(zé)早期器官起始,而逐漸上調(diào)變化的基因主要參與器官原基形成。同小鼠發(fā)育表達(dá)譜以及人胚胎干細(xì)胞各種組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較分析,進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)干性相關(guān)基因呈逐漸降低的趨勢(shì),而分化相關(guān)基因呈現(xiàn)兩種表達(dá)模式。 在此基礎(chǔ)上,整合蛋白質(zhì)相互作用信息,挖掘人胚胎早期器官過程中相互作用網(wǎng)絡(luò)(hORGNet),由兩個(gè)細(xì)化的與干性相關(guān)的模塊(hStemModule)和與分化相關(guān)的模塊(hDiffModule)模塊組成,分別表征干性潛能狀態(tài)變化情況與分化狀態(tài)。進(jìn)一步通過小鼠表型富集分析,hStemModule可能與胚胎早期致死相關(guān),而hDiffModule則可能多的是與出生后致死相關(guān)。這一研究建立了上*的人早期器官形成期基因表達(dá)的譜式,為探索人類發(fā)育早期的分子調(diào)控和人多能干細(xì)胞體外的定向誘導(dǎo)分化提供的寶貴的信息。
340-90-9 [4-(2-naphthyl)phenyl]boronic acid 4-chloropyridine
340-05-6 918799-14-1 626-64-2
340-05-6 3-溴-4,5,6-*氧基-2-甲基苯... 4-羥基吡啶
339-59-3 3-bromo-4,5,6-trimethoxy-2-methylphenol 4-Pyridinol
339-59-3 918879-58-0 626-67-5
338-98-7 H2ATSM/A N-甲基哌啶
338-98-7 H2ATSM/A N-Methylpiperidine
338-95-4 919346-89-7 626-72-2
338-95-4 5-溴異二氫吲哚鹽酸鹽 L-高胱氨酸
338-84-1 5-Bromo-2,3-dihydro-1H-Isoindole Hydrochloride 4,4'-dithiobis[2-aminobutyric] acid
338-84-1 919347-69-6 626-82-4
338-83-0 5-醛基吡啶-3-硼酸 己酸丁酯
338-83-0 5-formylpyridin-3-ylboronic acid butyl caproate
338-76-1 919475-15-3 626-86-8
338-76-1 2-[4-(芐氧基)苯基]-N,N-二甲... 己二酸單乙酯
338-69-2 Benzeneacetamide, N,N-dimethyl-4-(phenylmethoxy)- Adipic acid monoethyl ester
338-69-2 920979-04-0 626-87-9
338-38-5 2-氟-3-碘-6-甲基吡啶 1,4-二溴戊烷
338-38-5 2-fluoro-3-iodo-6-methylpyridine 1,4-Dibromopentane
336-59-4 921205-03-0 626-88-0
336-59-4 3,3'-[5'-[3-(3-吡啶基)苯基][... 1-溴-4-甲基戊烷
335-76-2 3,3'-[5'-[3-(3-Pyridinyl)phenyl][1,1':3',1''-terphenyl]-3,3'... 1-bromo-4-methylpentane
335-76-2 921630-14-0 626-89-1
335-67-1 2-溴-5-氯吡啶-4-甲醛 4-甲基-1-戊醇
335-67-1 2-Bromo-5-chloropyridine-4-carboxaldehyde 4-Methyl-1-pentanol
335-64-8 923009-50-1 626-93-7
335-64-8 1-氧代-2,7-二氮雜螺[4.5]癸烷... 2-己醇
335-57-9 tert-butyl 2-ethyl-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.5]decane-7-carboxy... 2-Hexanol
335-57-9 923009-50-1 626-97-1
335-56-8 2,7-二氮雜螺[4.5]癸烷-1-酮 戊酰胺
335-56-8 tert-butyl 1-oxo-2,7-diazaspiro[4.5]decane-7-carboxylate valeramide
334-88-3 923032-59-1 627-00-9
334-88-3 1-烯丙基環(huán)丙磺酰氯 4-氯丁酸
334-64-5 1-Allylcyclopropane-1-sulfonyl chloride 4-chlorobutyric acid
334-64-5 923036-30-0 627-03-2
334-63-4 N-甲基-N-((3R,4R)-4-甲基-1-... 乙氧基乙酸